варианты:
1) почистить от пыли
2) смазать подшипники вентиляторов
3) заменить вентиляторы на новые - малошумящие (у некоторых моделей есть даже такая маркировка - silent)
4) улучшить систему охлаждения в корпусе - поставить дополнительные вентиляторы, или заменить старые на вентиляторы большего диаметра (при том же объеме перекачиваемого воздуха они имеют меньшее число оборотов и меньше шумят)
5) отрегулировать частоты вращения вентиляторов (через систему или с установкой доп. устройств - реобаса)
6) экзотический - установить систему жидкостного охлаждения
смотри также
http://www.arbyte.ru/silentpc.shtml http://www.oszone.net/2978/ http://tishina.info/