Для удаления «пробок», которые служат очагом инфекции, назначают промывание лакун миндалин. Однако улучшение самочувствия при этом сохраняется недолго, и промывания приходится повторять регулярно. Помимо этого при обострении тонзиллита проводят полноценный курс лечения антибиотиками.
Однако часто, несмотря на лечение, миндалины не восстанавливают свою защитную функцию. Постоянно существующий очаг стрептококковой инфекции в миндалинах может привести к возникновению (и утяжелению течения) различных заболеваний: гломерулонефрита, ревматизма, пороков сердца, заболеваний органов пищеварительного тракта и т. д.
К сожалению, добиться полного восстановления защитной «пограничной» функции миндалин у больного хроническим тонзиллитом, затруднительно. Поэтому первоочередной задачей лечения становится повышение системного (то есть общего) иммунитета.