Может ли энергия связи быть отрицательной? Энергия связи в подсчетах получилась отрицательной. Может ли такое быть?

Она отрицательна.

Энергия связи может быть трех состояний. Притяжение или плюс, отталкивание или минус и нуль плоскость, в которой переходная область между теми двумя.

По определению:
(энергия связи) = (сумма энергий покоя компонентов системы) - (энергия покоя системы).
Смотрите, то ли и от того ли отнимаете.