Почему мыши хорошие, а крысы плохие?

1. Мыши травоядные, а крысы всеядные. Т. е. мыши Вас не сожрут, а вот крысы вполне могут. Из-за всеядности, крысы вполне вольготно живут в городах, на кораблях и т. п., и соответственно, крысы чаще вредят людям в городе, чем мыши.
2. Мышка размером с палец, а крупная крыса размером с кошку.

В общем, мышка - это что-то маленькое и безобидное, а вот крыса (особенно выползшая из канализации или пожирающая труп) - это существо злобное, противное и опасное.