Подписан агентский договор, есть ли у меня право отказаться от вычета из моей зарплаты 28% в фомс?

Выплаты в ФОМС по агентскому договору обязательны.
https://its.1c.ru/db/answers#content:3293:hdoc

платить страховые взносы заказчик обязан из собственных средств, а не вычитать их с вознаграждения по договору ГПХ.
от уплаты страховых взносов с выплат физ. лицам отказаться невозможно, нет такого права ни у кого.