Всбесился ли Касперский? Только что Касперский сам удалил msi.exe из папки Windows,что это?

явно не msi

Касперский не нужен. Он сам и есть вирус.

И что? Под видом этого файла может быть спокойно вирус быть

Это? это вирусы качать меньше надо вам.

Прежде всего, убедитесь, что у вас установлена актуальная версия антивируса, чтобы узнать полный номер версии выполните рекомендации из статьи https://support.kaspersky.ru/common/diagnostics/1690
Если версия продукта младше чем 19.0.0.1088, то обновите ваш антивирус, как описано в статье https://support.kaspersky.ru/common/start/13514, сохраните Информацию о лицензии и Файлы карантина
Если версия продукта актуальная или после её установки, восстановите фаил msi.exe из карантина и выполните полную проверку как описано в статье https://support.kaspersky.ru/13622.
Пришлите результаты этой проверки, для этого откройте главное окно программы, как описано в статье https://support.kaspersky.ru/common/start/13825
Нажмите кнопку Больше функций, затем кликните по строке Отчеты. В окне Отчеты представлена краткая информация о событиях. Чтобы получить подробную информацию о работе компонентов и выполнении задач, нажмите на ссылку Подробные отчеты. В верхней части окна нажмите на кнопку Экспортировать.
В окне Сохранение укажите место хранения и имя файла. Нажмите Сохранить.
Сохраненный файл отчета выложите на любой файлообменник, ссылку на который укажите в ответном сообщении

msi.exe - это и есть вирус. Гугл вам в помощь

Откройте карантин Касперского и посмотрите, что там написано в строке с вашим msi.exe. Напишите нам в дополнении к вопросу или дайте скриншот. Антивирус Касперского примечателен тем, что ЛК удалось добиться почти нулевого уровня ложных срабатываний, поэтому, если он удалил файл, то было за что.
Сейчас проверил у себя: в папке Windows (у меня Windows 7) файла msi.exe не найдено, как и во всех вложенных папках. Выводы сделайте сами.