Армия и исполнительная власть

«Армии» в Российской Федерации де-юре нет. Это обывательское слово. Есть Вооруженные Силы Российской Федерации.
Их деятельность регулируются Конституцией РФ, соответствующими законами. Главнокомандующим, по Конституции, является Президент.
Исполнительная власть — это самостоятельная ветвь власти, представленная Правительством РФ и администрациями субъектов федерации.
Министр обороны — член Правительства. Так что в некотором смысле, вполне теоретическом, Вооруженные Силы часть исполнительной власти.

В некоторых странах должность Министра обороны вовсе отсутствует, общее руководство армией осуществляет начальник генерального штаба.

Вообще Военные, Армия, т. е. Вооружённые Силы РФ должны быть самостоятельным органом государства-не зависимым от разделения властей и не относящемуся ни к какой из ветвей власти!