Рут не работает!

Однажды у меня тоже была подобная проблема и я решил её, убрав все разрешения в папке, где лежали файлы. Потом когда заменишь файлы, не забудь разрешения вернуть обратно... Попытка, не пытка).
Надеюсь ты в курсе и не надо повторять, что на всякий случай нужно иметь прошивку в телефоне и накатить её через twrp в случае форс мажор.

То, что у тебя и boot прошит и рут стоит не значит, что ты можешь рут эксплорером любой файл прошивки подменить, у них и атрибуты есть и они ещё и могут использоваться системой на данный момент. И раз ты один из немногих мастеров в городе, то путь твой лежит к созданию собственной прошивки