Способна ли покраска деревянных поверхностей скрыть стыки двух деревянных элементов, визуально объединив их в один?

нет. или нужно толстый слой краски

от качества стыка зависит

не всегда, зависит от материала и качества обработки

Если хорошо подготовлена поверхность и краска не глянцевая, то вполне

Если стык в одной плоскости, ничего не выпирает – то запросто.

Слой краски составляет доли миллиметра. Даже десять слоёв и полмиллиметра не наберется…
Вы опишите получше вашу проблему. Может быть, подойдут совсем другие способы исправления «косяков» при изготовлении …
Если нельзя зашлифовать стык, а шпаклёвка получается слишком толстой, тогда применяется метод «как будто так и задумывалось» - внешнему виду придаётся состояние бывшего в употреблении, «старинной» вещи.
Есть фактурная краска, больше напоминающая штукатурку.
Есть метод декупажа, когда оклеивают предмет бумагой с рисунком и покрывают лаком…
https://www.ivd.ru/dizajn-i-dekor/dekorirovanie/modnyj-vintazh-15-prostyh-sposobov-sostarit-mebel-tekstil-i-aksessuary-42991