Если официально все было и по документам, то думаю, что лучше в суд, а если нет, то нужно собрать максимальное колличество доказательств ( например переписки с работодателем) и в полицию
В суд, конечно. Самозанятый -- равноправный договорной партнёр. А в частные споры между заказчиком и исполнителем никакая прокуратура или полиция вмешиваться не имеют права.