КС-2 с одними материалами без работ, а почему нет?

Если подрядные работы ведутся на основании сметы, то КС-2 составляется по смете. Например, в смете написано одной строчкой "материалы" и суммы, тогда в КС-2 можно одной строчной. Другой вопрос, что налоговики не признают это обоснованным расходом, потому что они попросят в этом случае уточнить наименование и количество материалов и проект, на основании которого ведутся работы.
Но если вам обещали стену толщиной в кирпич, а положат в полкирпича, то подписав КС-2, вы согласились на полкирпича и будете потом спорить, вы подписали фактически выполненные работы или указанные в договоре (проекте).
И если вы бухгалтер, то отсылайте к юристу или к директору. Если директор подпишет, то расскажите ему о последствиях и рисках (про полкирпича и налоговиков)

вас смущает отсутствие разбивки по материалам или отсутствие работ? Если нет работ, то это уже не договор строительного подряда.

КС-2 строители составили? Что-то новое...КС-2 и КС-3 составляются на основании сметы к договору строительного подряда. Если там одни материалы, суть Акта о приемке выполненных работ теряется. И явно не определяется договором строительного подряда. На куплю-продажу смахивает.