Можно ли построить дом из нескольких морских контейнеров, что бы их не регистрировать как жилье?

Нельзя. Будет как циганское жилье. Под снос

могут наехать на основании того что дома нет на земельном участке. То есть использование земельного участка не по виду разрешенного использования могут прописать. Но это не сразу, и не быстро,
А так если домик есть уже можешь ставить что угодно.