Можно ли пойти в отпуск в середине недели например в среду четверг стоит ли так делать?

Можно

Не знаю, спроси у начальника или работадателя

Ограничений нет. Дату начала отпуска можно в заявлении указать любую, дальше зависит от работодателя, насколько удобно ему ваше отсутствие именно в такие сроки.
Например, я стандартно ухожу в отпуск с 1 июля независимо от того, какой это день недели, потому что другие варианты не вписываются в график учебного процесса.