Почему после пробежки у меня опухло колено сверху.

Ты чё опух ?

Бурсист.

Скорее всего вы бегали не правильно или в плохо обуви, вот советы по бегу https://healthytogether.ru/healthy-lifestyle/run

Может быть травма сустава или заболевание. К врачу сходите, я обращался примерно с такими же симптомами. Оказалось, что начинается артроз. Посоветовали уколы Амбене био, их проделал, через некоторые время забыл про боль и отек с сустава сошел довольно быстро. В общем, не тяните, к врачу идите за адекватым лечением.