Как поставить видеокарту с очень толстой системой охлаждения на маленькую материнскую плату?

Вот так ПК собери и что угодно установишь

упирается и мешается?

Тут не от видеокарты и материнки зависит а от корпуса, ну и усиленный PCI-E слот конечно лучше иметь под такую бандуру плюс стойку. А всё что перекрывает видеокарта подключаете заранее и она не мешает.

Разъем передней панели никак не мешает установке видеокарты. Подогни провода у разъема и всего делов.

Карту менее габаритную или плата формата АТХ

Да и ладно, мне можно еще парочку впендюрить только зачем, все же зависит от корпуса, а не от маленькой материнской платы!

Здравствуйте,

Высота системы охлаждения видеокарты не оказывает какого-либо влияния на совместимость с системными платами, в том числе с системными платами форм-фактора mATX с полноскоростностным разъёмом PCIe в нижней части системной платы, расстояние от системы охлаждения видеокарты до системной платы вполне достаточное для подключения кабелей корпуса, для подключения накопителей с интерфейсом SATA можно использовать кабели с угловыми разъёмами, однако при использовании видеокарты с 2.5-слотовой системой охлаждения как у видокарт на базе GTX 1080 Ti серий JetStream и GameRock производства Palit Microsystems в корпусах форм-фактора mATX расстояние до нижней части корпуса может быть недостаточным для доступа воздушного потока к вентиляторам системы охлаждения видеокарты, что может заметно повысить температуры в нагрузке, поэтому целесообразно использовать видеокарту в корпусе форм-фактора ATX с вентиляционными отверстиями на передней панели с предустановленными вентиляторами с достаточно эффективным охлаждением, пример модели корпуса в розничной продаже: https://www.onlinetrade.ru/catalogue/kompyuternye_korpusa-c1323/powercase/korpus_powercase_mistral_t4b_le_chernyy_cmitb_l4-3299343.html , также учитывайте, что для конфигурации с видеокартой на базе GTX 1080 Ti с потреблением до 350W требуется качественный блок питания мощностью от 650W - 700W, при покупке видеокарты на вторичном рынке обязательно договаривайтесь о тщательной проверке стабильности, температурного режима, температуры графического процессора в условиях открытого корпуса, чтобы не учитывать влияние эффективности охлаждения в корпусе, в игровой нагрузке не должны превышать 74-76 градусов, температуры по термодатчику температуры горячей точки процессора GPU Temperature (Hot Spot) не должны превышать 90-95 градусов, и отсутствия посторонних шумов у вентилятора/вентиляторов с шагом 5-10%, при этом учитывайте, что синтетические тесты типа FurMark'а не имеют отношения к реальной игровой нагрузке и могут не выявлять неисправные видеокарты, к тому же использование видеокарты в такой нагрузке может вызвать аппаратную неисправность видеокарты, информация на сайте NVIDIA: https://support.nvidia.eu/hc/ru/articles/5535911772562 , поэтому используйте для проверки требовательные игры либо бенчмарки с нагрузкой, соответствующей игровой нагрузке, например, бенчмарк любой из игр серии Metro с максимальными настройками от трёх-пяти прогонов, бенчмарки актуальных игр серии Tomb Raider, для видеокарты на базе GTX 1650 SUPER можно использовать бенчмарки Metro Exodus, Shadow of the Tomb Raider и Cyberpunk 2077, бенчмарк UNIGINE Superposition: https://benchmark.unigine.com/superposition и тест устойчивости 3DMark.

Специальную поддержку для видеокарты купи

это тоже самое что впихнуть огромный болт в маленькую гайку

Разъемы никак не мешают если всяких приблуд не стоит.
Просто в правильной последовательности собирай комп и всё будет хорошо