На какое дно моря (каменистое или глинистое) можно опустить подводную лодку и почему?

Только на каменистое! Если положить на глиняное, то значительно уменьшится площадь дна лодки, на которую давит вода, а значит сила Архимеда значительно уменьшится и подводная лодка рискует никогда более не всплыть.