Как правильно пишется: кого вы ищете или ищите?

В данном случае повелительное наклонение не имеет к вопросу никакого отношения. Окончание глагола в изъявительном наклонении определяется по спряжению. Глаголы в повелительном наклонении спряжения вообще не имеют. В указанном примере глагол в изъявительном наклонении. Спряжение определяется по окончанию. Всего два спряжения: первое и второе. Поскольку в слове "ищете" ударение падает на основу, и определить на слух окончание нельзя, спряжение определяем по инфинитиву: "искать", - окончание "-ать" - значит это первое спряжение. Следовательно в слове "ищете" окончание "-ете".
Ко второму спряжению относятся слова имеющие в инфинитиве окончание "-ить" (кроме брить, стелить, брезжить, зиждиться) , семь глаголов на "-еть" (смотреть, видеть, зависеть, ненавидеть, терпеть, вертеть, обидеть) и четыре глагола на "-ать" (слышать, дышать, держать, гнать) . Остальные глаголы с безударным личным окончанием относятся к первому спряжению.
Глаголы первого спряжения имеют окончания -ешь, -ет, -ем, -ете, -ут, -ют.
Глаголы второго спряжения имеют окончания -ишь, -ит, -им, -ите, -ат, -ят.