Оплата командировочных расходов сотруднику работающему менее 1 года.

В Вашем вопросе меня смутила фраза :

«Типа весь суммарный мой доход поделила на кол-во рабочих дней за предыдущий календарный год, соотв-но у меня все многократно уменьшилось»

Порядок расчета среднего заработка, сохраняемого за работником во время нахождения в служебной командировке, установлен ст. 139 ТК РФ и Положением об особенностях порядка исчисления средней заработной платы, утвержденным Постановлением Правительства РФ от 24.12.2007 N 922.
В общем случае расчет производится исходя из фактически начисленной заработной платы и фактически отработанного времени за расчетный период, который включает 12 месяцев, предшествующих периоду, в течение которого за работником сохраняется средняя заработная плата. При этом календарным месяцем считается период с 1-го по 30-е (31-е) число соответствующего месяца включительно (ч. 3 ст. 139 ТК РФ, п. 4 Положения об особенностях порядка исчисления средней заработной платы) .

В данном случае расчетный период составляет ( с ноября по март), если в командировке были в апреле)

В частности, для расчета среднего заработка учитываются заработная плата, начисленная работнику по должностному окладу за отработанное время, а также премии и вознаграждения, предусмотренные системой оплаты труда ( с ноября по март) если в командировке были в апреле)
При расчете среднего заработка используется средний дневной заработок, который исчисляется путем деления суммы заработной платы, фактически начисленной за отработанные дни в расчетном периоде, на количество фактически отработанных в этот период дней (абз. 3, 5 п. 9 Положения об особенностях порядка исчисления средней заработной платы) .
Поэтому попросите представить расчет командировочных и уточните какой расчетный период брался в расчет 12 месяцев или 5 месяцев.