почему севастополь сделали городом федерального значения?

Он и был. Сейчас только восстановили справедливость.
29 октября 1948 г. указом Президиума Верховного Совета РСФСР Севастополь был выделен в самостоятельный административно-хозяйственным центр со своим особым бюджетом и отнесён к категории городов республиканского подчинения РСФСР.

Потому что там стоит Черноморский флот России.

там военный порт! Это не хухры-мухры

Говорят, сделали потому что Чалый лично об этом Путина попросил.

Объективных причин на самом деле не было никаких, чтобы делать Севастополь отдельным субъектом федерации. По крайней мере ни один другой город, являющийся местом базирования флота субъектом не является (кроме Санкт-Петербурга, но там совершенно другая причина). Если говорить о флоте или еще чем-то, то тогда есть масса городов в России, которые заслуживают такого статуса не меньше Севастополя, т. е. имеют не меньше значимости.

Надо ли было давать такой статус Севастополю? Учитывая сколько нарушений законодательства это принесло, то нет. Дело в том, что закон о приеме в состав России иностранных государств в качестве субъектов не предусматривает принятия такого государств сразу в качестве двух субъектов федерации и, во-вторых, не предусматривает получения статуса города федерального значения (по умолчанию - республика, может быть также область, край или автономная область). Т. е. грубо нарушили закон, спрашивается, зачем это надо было? Не факт, что потом эта тема потом не всплывет и не станет юридическим обоснованием требования вернуть Крым Украине.

Разговоры, что это так традиционно Севастополь имел отдельный статус в корне не верно. Статус, который был при царях и статус города республиканского подчинения в советское время имеют мало общего с современным "городом федерального значения". Последний подразумевает большую автономию (самоуправление) и законодательные полномочия как субъекта федерации. А город республиканского подчинения, напротив, - это статус, который подразумевает чисто внешнее управление (непосредственно республиканскими властями). Схожесть статусов только в том, что в обоих случаях город не зависит от решений, принимаемых в том субъекте, который его окружает (Республики КРым в данном случае). Т. е. городу Севастополь дали полномочия, которые ему по сути не нужны и не имеют надобности быть. При этом управлять городом пытаются так, как будто это не самостоятельный субъект федерации, а именно город чисто федерального подчинения. Отсюда и конфликт там был насчет губернатора Меняйло - его фактически навязали городу федеральные власти, а мнение самих горожан, как жителей отдельного региона, никто не спрашивал. Всё из-за того, что сам нынешний статус Севастополя городу просто не подходит.

Не знаю, почему, но мне как-то сразу вспомнился момент насчёт Италии, Рима и Ватикана...