Что за должность – советник? В чем отличие советника от заместителя и кто главнее ?

Советник это должность, на которую переводят работников, бывших начальников, ранее имевших заслуги перед организацией, которых жалко выгнать с работы. Пока жалко.

Заместитель имеет право выполнять ОБЯЗАННОСТИ начальника.
А советник - только даёт рекомендации или прорабатывает вопросы, но решений не принимает.