Какое образование нужно иметь, чтобы работать секретарем/помощником руководителя? Какие программы нужно знать?

Наименование должности "секретарь" - это очень общее название. Есть секретарь - помощник руководителя или секретарь отдела (подразделения), или секретарь в небольшой частной компании. В этих случаях работник выполняет совершенно различные виды работ. Поэтому для начала надо для себя решить - секретарем чего (кого) Вы намерены стать.
Чтобы стать секретарем - помощником руководителя в крупной компании, безусловно, надо иметь высшее профильное образование (обычно гуманитарный ВУЗ, факультет делопроизводства). Здесь получаете знания во многих областях, тем не менее многие знания придется добывать самостоятельно путем посещения дополнительных курсов, изучения специальной литературы и т. д. Представлять достаточно конкретно системы управления предприятиями. Если компания имеет зарубежные связи, то необходимо знание иностранного языка или нескольких.
Если выбрали должность секретаря подразделения, то на первом месте стоит основы делопроизводства, архивное дело, умение работать с оргтехникой, архивное дело ( хранение документов, образующихся в деятельности предприятия или отдела). Все эти навыки можно получить непосредственно в практической деятельности или занимаясь самообразованием.
Если устраиваетесь на работу в небольшое предприятие, сперва надо поинтересоваться, что от Вас будут требовать. Обычно в маленьких "конторках" секретари, помимо своей непосредственной деятельности могут вести фрагменты бухгалтерского учета, еще какие-то работы. А могут вообще ничего такого особенного не требовать, а только отвечать на входящие звонки.