Как понять «необходимо исключить»?

например "необходимо исключить такие-то продукты",
т. е. эти продукты нельзя употреблять.

Не использовать что-то из перечисленного.

если это про болезнь, то скорее всего имеется ввиду, что при некоторой симптоматики необходимо исключить в первую очередь такие то болезни
например, проведением дополнительных анализов
может из-за наибольшей опасности, может из-за наибольшей вероятности
и только потом копать дальше
т. е. в данном контексте "необходимо исключить" значит что то вроде "проверить на эту болезнь в первую очередь" или "в обязательном порядке"

ДА... мы иногда пишем - следует исключить инфаркт, то есть кардиограмма двусмысленная и по одному исследованию высказаться однозначно просто невозможно