Майор и подполковник полиции РФ различаются между собой только видами погон, или чем-то ещё? Чем именно?

Должностью, обычно.. часто возрастом. Иногда полом (неточно, Ирина ВолкПозорный вообще генерал)).

Что за вопрос? Специальным званием есть отличие. И старший по званию вполне может отдавать приказы младшему по званию, если конечно должность у младшего по званию не выше. И такое бывает)