Если жи/ши пишится через и то как правильней писать ц/ч?

После Ч, пишется буква И (и не пишется ы) : чистый, лучи.

Примечание. В некоторых иноязычных собственных именах после Ч пишется буква Ы, например: Чыонг Тинь (вьетнамское собственное имя).

После Ц пишется буква И или Ы.

Буква Ы пишется в следующих случаях.

1. В корнях слов: цыган, цыплёнок, цыпка, цыпки, на цыпочки, на цыпочках, цып-цып, цыц, цыкать, цыркать (и в производных словах, напр.: цыганка, цыганский, выцыганить, цыплёночек, цыпонька, зацыкать, цыкнуть, цыркнуть).

2. В окончаниях существительных и прилагательных, напр.: огурцы, стрельцы, столицы, Клинцы, Люберцы; куцый, бледнолицых, узколицыми.

3. В суффиксе прилагательных −ЫН, напр.: сестрицын, лисицын, царицын, Троицын день. Так же пишутся географические названия на −цын, −цыно, напр.: Царицын, Голицыно.

Примечание. В русских фамилиях после Ц пишется буква И или Ы в соответствии с традицией и с регистрацией в официальных документах, напр.: Ципко, но Цыбин; Куницын, Курицын, Синицын, Скобельцын, Солженицын, но Вицин, Ельцин, Цицин.