Серьезный вопрос мужчинам...по работе..Это он правда так думает?

Значит так:

- во-первых, он выразил своё недовольство в целом, ко всей конторе, где Вы работаете;

- во-вторых, также выразил недовольство, по поводу других заведений, с которыми ему приходится работать/общаться;

- и в третьих, но здесь Вы сами себе должны ответить:

а) если Вы лишь отдаете ему какие документы, допустим, и, на этом Ваше с ним общение заканчивается, значит он высказал лично Вам комплимент - именно как девушке, которая ему нравиться;

б) если же Вы, выполняете какую то работу для него, с его документами или Вы вместе, во время его нахождения с Вами - вместе что-то делаете для него, то он выразил своё восхищение, что Вы грамотный работник;

в) возможно, что и подпункт а) и подпункт б) - оба правильные, то есть Вы ему и нравитесь, как девушка и как работник.