Старшая сестра и младший брат с одной фамилией, а средний с другой, как это может быть?

Разные отцы, либо приемный

Среднего просто не любят, дали ему другую фамилию чтобы их фамилию не позорил

Можно при рождении выбрать другую фамилию. У меня братик так с другой

Ну может кому--то дали фамилию матери( она не меняла) кому--то отца....Может мать уходила к другому, родила там детей и опять вернулась к прежнему...--родила.