Пирантел прочищает весь организм? или только кишечник

Весь. Таблетки всасываются в кишечник и попадают в кровь.
Через 2 недели после приема снова выпей таблетку.

Пирантел это антигельминтное средство, и оно ничего не "прочищает".
Очисткой у нас занимаются на уровне органов: печень и почки, на уровне клеток - переваривание на уровне макрофагов, но минуя воспалительную стадию.