Есть хоть какое-то логическое объяснение возникновения энергии и элементарных частиц

Нет

Есть.

Божья воля

сами "элементарные частицы" и представляют из себя сгустки энергии...
причём эти "сгустки энергии" бывают ОЧЕНЬ разными по строению и свойствам!

Давно выяснено, это энергия Первичного Гравитационного Потенциала, в рамках полиэфирной модели.

Тут не логика нужна, а знания, которых пока нет. А логически непротиворечивых философских построений на эту тему очень много.

Логичеких сколько хочешь.
...математических нет.
Частицы это стоячая волна электромагнитного поля. Но интерфененции в трехмерном пространстве... хрен рассчитаешь.

Элементы материи дискретны по строению и всегда находятся в движении и во взаимном столкновении

Всё объясняется движением Эфира.