Есть ли научное обьяснение за счет чего в эффекте джанибекова барашек имеет попеременное вращение каждой оси?

Да, конечно, научное объяснение есть.
Если тело имеет такую симметрию, при которой с одной и той же скоростью углового вращения, имеется 3 разных момента вращения (например, прямоугольный параллелепипед с тремя разными сторонами), то устойчиво будет вращение вокруг осей с максимальным и минимальным моментом вращения. А вращение вокруг третей оси будет неустойчивым. Например, спичечный коробок будет неустойчиво вращаться вокруг оси, которая перпендикулярна трущим поверхностям (темно-коричневого цвета) и проходит через центры этих поверхностей.