Если двигатель который установлен, устанавливался на эту модель по спецификации завода-изготовителя - никаких проблем. Идешь и ставишь.
Если двигло не ставилось на эту модель по заводу - учет только через оформление внесений изменений в конструкцию и т.д. Скажем так, дешевле новую машину купить, чем с чужим, замененным двиглом на учет поставить