Имеет ли место быть боковая крышка на корпусе если без нее охлаждение лучше?

без разницы +-

имеет, иначе много пыли

Тут вопрос во внешних факторах, таких как насекомые (повреждения которыми не являются гарантийными), домашние животные, которые и сами могут повредить комплектующие, но и шерсть, которая очень сильно будет забивать пк, так же придётся гораздо чаще чистить пк от пыли, но температуры при этом действительно упадут

Она его защищает. Ее бы никто не делал если бы без нее было лучше.

поставь из сетки борт