из серии: страшные вопросы про собачью ЧУМКУ!

Конечно же, вольер нужно обязательно продезинфицировать. Зараза может сохраняться год и даже больше, так что если не продезинфицировать, будет то же самое со всеми остальными собаками.
Если в вольере песок или гравий, его надо сменить. Если земля - необходимо снять верхний слой, вывезти куда подальше, пол в вольере засыпать новым песком или гравием. Если пол деревянный или бетонный, а также всё остальное (будку внутри и снаружи со всех сторон, ограждения, миски, все места, где больной щенок бывал вне вольера) необходимо обработать (вымыть тщательно) дезинфицирующей жидкостью. Их много разных видов, смотря какие сможете найти в продаже. "Вирпол", "Демос", "ЗооСан" и другие. Если туго с финансами или нет возможности купить спецсредства - хлоркой просто. Только потом надо хорошо смыть, чтобы новый щенок не отравился.
Кроликов и цыплят держать можно, они собачьей чумой не заболеют. Но вольер всё равно лучше продезинфицировать. Вирус-то заразный. А дедушка так или иначе будет держать собаку, как я понял (в деревне, понятное дело, без неё нельзя) . Она может заразиться, и просто подойдя к вольеру. Кто знает, где там вирус остался. Особенно если щенок жил не только в вольере, но и бегал по двору, участку и т. п.