Дочери исполнилось 14 лет. Хотим поменять фамилию, но в загсе требуют (разрешение от отца). Где он находится не знаю.

Может подождать до совершеннолетия и тогда сама сменит?

Всё верно требуют. Через 4 года его разрешение не нужно.
Если хотите сейчас, то подавайте иск о признании гражданина безвестно отсутствующим. После признания его таковым, его разрешение будет не нужно, но тогда будет нужно разрешение ООиП.

Детей хотят переименовать чаще, чем собак...

Вдруг дочери наследство упадет от отца.. что так сразу рубить сук..