Мы работали с несколькими, но самая удачная программа для учета договоров это «Ведение договоров 5.7». Очень удобная, с простым интерфейсом, с возможностью работы со сканером, с функцией заполнения реквизиторов по ИНН, буквально одним нажатием программа сама формирует счет-фактуру, накладную, счет, акт сдачи-приемки и т. д. в общем, плюсов масса, минусов пока не нашли, хотя работаем на ней уже года полтора, программу советую. Приобретали ее в этой компании
http://araxgroup.ru/content/view/27/72/ на сайте можете посмотреть ее стоимость и скачать бесплатную версию, но скажу сразу, она стоит своих денег, не пожалеете.
Объемы договорной работы большие, программа нужна достаточно устойчивая к большому количеству информации. И чтобы были оповещения, возможности сортировки по контрагентам. Короче полный фарш.