Почему показывает отрицательное значение высоты?

настройки на конкретный эшелон.
так как он проходит среди гор-приняты дополнительные меры безопасности
возможно ты ниже уровня моря.
В разных станах разная система настройки альтиметров, на западе чаще настраивают ноль на уровне моря, т. е. находясь на полосе ты видишь по приборам что находишься на некой высоте, отличной от нуля. В других странах (в том числе, насколько знаю, в России) настройка альтиметра на ноль может производиться на полосе, то есть стоя на полосе ты увидишь по приборам нулевую высоту, это значит, что если ВПП находится достаточно высоко, есть шансы уйти в минуса, отлетев достаточно далеко. Впрочем, на малых высотах расстояние до земли оценивается по отражённому от земли сигналу, а не по давлению воздуха, на которое опирается альтиметр, так что эта разница не существенна.
база где то выше.