У вас разный порядок признания расходов:
материальные расходы связанные с производством готовой продукции -комплектующие из которых вы производите готовую продукцию -окна. Эти расходы можете сразу принять при расчете УСН.
и есть расходы на закупку товара, которые вы принимаете в затраты по УСН по мере того как этот товар будет продан и оплачен.
*
Поэтому если у вас ведется раздельный учет товара и материалов для производства, то затраты на материалы вы сразу сможете включить в затраты по УСН, а если все в одной куче и товар и материалы, то не стоит.
Вообще-то в 1С Бухгалтерии это все считается. и остатки тоже.
Почитайте НК РФ гл. 26.2.
НК РФ Статья 346.16. Порядок определения расходов
http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_28165/2428f19fbea7040de2388dd179c39e787cc0d07d/*
Если у вас расходы по материалам, больше дохода по УСН, то включите в расходы по УСН только такую сумму чтобы выйти на 1% c дохода по УСН, но не больше. Потому как если вы покажите полное количество расходов и у вас будет убыток по декларации, то сразу начнутся документальные проверки ФНС. Оно вам надо? Легче показать расход под 1% и все. А остальные расходы в следующем году учтете.
P.S.
когда на расчетный счет поступали ср-ва за изготовление окон, то я на них сразу-же закупал комплектующие. И на складе у меня имеются комплектующие. Т. е. по факту мои доходы выше расходов.