Железо и марганец исходной воды выпадут в осадок и несколькими промывками, пропуская воду через фильтр, вы воду очистите. Для обеззараживания воды можно использовать хлорные таблетки и установку УФ-обеззараживания:
https://waterdos.ru/product-category/uf-sterilizatory