Как сделать из фото картину по цветам?

Во-первых, это ошибка - путать аддитивные и субстрактивные цвета. Это блин настолько разные вещи, что можно смело послать нахрен задающего подобный вопрос. Особенно в магазине, где ты будешь затариваться красками.
Во-вторых, компьютерная колеровка краски всё-таки бывает. Но это будет стоить дорого. Очень.

Самый простой способ - разбить изображение на цвета в фотошопе или adobe кулере, напечатать это в фотолабе и идти в магаз сверяться с реальными образцами прямо по бумажке до максимально близкого соответствия.

Если ты не художник или очень хреновый художник, который сейчас впервые в жизни прочел то, что я пишу, то лучше закажи такое у нормального художника. Он сам всё подберет и сам всё в палитре смешает. Потому, что умеет. Вопрос наиглупейший. Ну правда.

Циферки самому придётся расставлять. А разбить по цветам не проблема. Проблема сделать это так, чтоб не выглядело страшно-аж-жуть... При этом, палитру можно применить и после. Но с той же оговоркой.
Далее можешь соорудить экшн по выделению цвета, копированию на новый слой, окраской в белый, и созданием обводки. А, можешь сделать это всё вручную. Пронумеровать можно будет после. Послойно.
И, нефиг думать, что это простенькая задачка. Разумеется всё можно ещё более астоматизировать, если владеть JS, и соорудить подходящий скриптик.

Главную мысль подчеркну: неспециалист с этой работой не справится, какая-бы программа у него на вооружении ни была. Никакая программа не сделает сама все красиво и правильно. Ищи не программу, а человека который сможет сделать тебе эту работу...