Нужно ли согласовывать закладку дверного проема без его переноса?

А само объединение узаконено? Если подходить строго по букве закона, то любое изменение конфигурации жилого помещения, изменяющего его план в техпаспорте, является перепланировкой. Поэтому и объединение жилой комнаты с кухней, и закладка дверного проёма, даже его перенос, является перепланировкой, и требует получение разрешение на неё.