Нужно ли вынимать из usb-порта беспроводную мышь при завершении работы ноутбука?

Не нужно, при выключение ноутбука должно прекратится питание usb портов, если только у вас в bios не стоит в настройках дежурное питание. Ну или если вы его не отправили в режим ожидания.