Если атом не имеет цвета, то как он выглядит тогда?

Так ты его даже увидеть не сможешь

как то так

он никак не выглядит, он меньше длины волны видимого света.

Молекулы из атомов состоят вроде, у меня по физике тройка, а цвет это разве не отражение света поверхностью...

Примерно вот так:

Понятие "выглядит" к атому неприменимо.

Что значит, в вашем понимании, "выглядит"?
"Выглядит" - это результат использования вполне определённого инструмента, а именно - света. Объект освещается, зондируется светом, рассеивает его, часть рассеянного света регистрируется нашим зрительным аппаратом, и появляется зрительное ощущение - объект как-то "выглядит".
Но для зондирования отдельного атома свет - инструмент слишком грубый.

Никак не выглядит. Он меньше длины волны видимого света, поэтому - да, он для нее практически прозрачен. В лучшем случае можно различить туманное пятнышко.
Цвет - зависит от вещества, но проявляется только при достаточном количестве участвующих атомов.

Он выглядит как текст на экране, описывающий его. Как мысль в голове, представляющая его. То есть глазом его не увидеть, а вот разумом воспринять можно. Он то, что кажется невозможным, однако именно им оно и является. Как если бы тебе сказали, что вокруг тебя множество невидимых лучей, которые вместе дают видимый луч. Но каждый лучик по отдельности ты увидеть не в состоянии, а лишь измерить длину волны этого излучения с помощью громоздких приборов.

Когда "тогда"?..

Невидимую частицу атома увидишь только при свете, они бывают разных размеров и из разной материи, как:
Луна, Земля, Плутон, Венера, Марс, Сатурн, Нептун, Уран и тд.
Только материя Солнца значительно отличается от другой материи

Б. Полевой спорно писал, ну что медведя зимой с пистолета убил, но в Силуэтах кричал молекулы нужно в воде смотреть микроскопом. Облака видны. Иголкой можно верю ньютону.