У Вас вирус троянский в системе! с подобной заразой, лучше всего этим бороться comp-edit.ru/best-antivirus/ на ура все вылавливает и исправляет ошибки.
Вариант 1 На флешке все папки получили аттрибут "hidden" - скрытый. Одновременно, в корневой папке появились файлы с теми же именами. Каждая попытка зайти в папку приводит к запуску файла. А файлы, естественно, с вирусом. Лечится : открыть флешку не проводником, а тотал командером, включить отображение скрытых и системных файлов. Файлы в корне удалить, со всех папок снять аттрибут "hidden"
Вариант 2 Никаких вирусов нет. Повреждена файловая система флешки. Лечится : зайти в "Мой компьютер", на значке флешки правый клик, свойства - сервис- выполнить проверку. Поставить галочку "автоматически исправлять ошибки диска". Если не помогло, запустить командную строку (пуск - выполнить - cmd) и в черном окне набрать chkdsk g: /f g: - это буква флешки, при необходимости подправить на нужную.
Вариант 3 Не помогли 1 и 2 Придется форматировать, данные убиваются. ЕСЛИ НУЖНО СПАСАТЬ ФАЙЛЫ ЛЮБОЙ ЦЕНОЙ, обращайтесь в сервис. Флешку нужно будет посекторно копировать и колдовать над полученными данными. Если не помогло, флешка физически битая. В урну.